被子植物353探針的主要優勢包括:
1.種類豐富:該探針提供了豐富的成品型目錄供用戶選擇,并且目錄會持續更新。此外,如果用戶需要目錄以外的物種或RNA,還可以進行定制。
2.工作流程快:該探針采用了一步法的工作流程,整個流程僅需70分鐘即可完成。
3.起始量范圍廣泛:該探針可以在100 ng到5μg的RNA起始量之間實現高效的去除效果。
4.針對特殊應用定向優化:該探針特別適用于ibosome profiling樣本和環境轉錄組學(如土壤、污泥)等特殊應用。
5.高效的去除:該探針具有高效的去除能力,結果穩定且可重復。
6.搭配靈活:該探針兼容各種RNA純化和RNA建庫方法,方便用戶根據需求進行選擇。
7.探針法:該探針采用探針法,沒有酶切偏好,可以均勻覆蓋轉錄本;同時,由于無需打斷樣本,降低了風險;此外,該探針還適用于無polyA結構的RNA(如snoRNA、LncRNA、組蛋白)。
8.兼容多種下游分析方法:該探針兼容多種下游分析方法,如RNA-Seq、微陣列分析和實時定量PCR等,為用戶提供更多的分析選擇。
被子植物353探針的維護涵蓋了探針的設計、使用和存儲等方面,需要特別注意的是保持其捕獲效率和覆蓋范圍。被子植物的生命之樹揭秘是現代植物生物學的一項重大成就,開花植物(被子植物)在維持陸地生物群落、全球碳循環以及為人類提供食物、藥物和其他多種生活必需品方面起著至關重要的作用。
在使用這些被子植物353探針進行靶向捕獲測序時,需要特別注意雜交的熱力學過程。這一過程部分受探針的DNA復雜性和長度的控制。更長的探針能夠容忍更多的錯配,使其更適合于不同物種的捕獲需求。同時,較高的探針重疊度(如75%)可以補償特定探針雜交失敗或低質量輸入材料的問題,這對于處理歷史植物標本等特殊樣本尤為重要。