被子植物353探針是一種采用靶向捕獲探針對特定的基因組區域進行選擇性地富集,再進行測序的技術。被子植物探針的靶向捕獲測序技術,從600種被子植物中,篩選353個單拷貝核基因,作為捕獲序列,利用生物素化的RNA探針長度120 bp,對被子植物的353個單拷貝核基因進行定向捕獲測序。該技術的優勢在于去除冗余數據的干擾,同時降低測序成本及基因組組裝的復雜性,進而提高NGS數據的利用率,促進被子植物的研究。
被子植物353探針是一種特殊的寡核苷酸探針,可以與植物基因組中大約80%以上的基因進行高度選擇性的雜交。這種探針的設計基于被子植物基因組中高度保守的序列區域,因此具有較高的特異性和敏感性,能夠在廣泛的植物物種中使用。
被子植物353探針還可用于以下方面:
揭示植物基因表達譜:使用被子植物探針可以對植物基因組進行全面的表達分析,揭示出植物不同發育階段和響應環境變化時的基因表達譜。通過對大量基因的表達水平進行定量測量,科學家們可以了解植物生長和發育過程中哪些基因起著重要作用,從而為植物育種和生產提供理論依據。
研究植物應對環境逆境的機制:植物在面對各種環境逆境(如干旱、鹽堿、低溫等)時,會觸發一系列的基因調控網絡以適應環境的變化。利用被子植物探針可以分析植物在逆境條件下的基因表達變化,進而揭示出植物應對逆境的分子機制和信號傳導途徑,為改良植物品種提供遺傳基礎。
探索植物進化歷程:被子植物探針不僅可以在現代植物中使用,還可以用于研究植物進化歷程中的關鍵基因。通過與不同植物物種進行比較分析,科學家們可以了解這些物種在基因組水平上的差異和變化,從而推測出植物進化的演化過程。